Miguel Xavier é Professor Catedrático de Psiquiatria e Saúde Mental na NOVA Medical School – Universidade Nova de Lisboa, onde exerce ainda os cargos de Sub-Director e Presidente do Conselho Científico.
É coordenador do Curso de Mestrado Internacional sobre Saúde Mental em Cuidados de Saúde Primários. É Consultor Graduado Sénior do Centro Hospitalar de Lisboa Ocidental. Coordenador de vários projetos de investigação em áreas como epidemiologia psiquiátrica, planeamento e avaliação de serviços de saúde mental, psiquiatria forense e educação médica. É autor ou coautor de mais de 300 apresentações e 120 publicações, bem como revisor regular de revistas no campo da psiquiatria e saúde mental..
Para além do seu trabalho académico e clínico, foi co-autor do Plano Nacional de Saúde Mental 2007-2016 e primeiro autor do Relatório de Avaliação do PNSM e Extensão a 2020. Atualmente é o Coordenador Nacional para as Políticas de Saúde Mental, no Ministério da Saúde.